师从王一亭、王个簃、潘天寿、诸乐三等名师。1932年在成都创办东方美术专科学校，1956年在四川美术学院担任山水、书法、篆刻、诗词教学，一生桃李满天下。生前曾当选为中国美术家协会四川分会理事、中国书法家协会理事、重庆国画院副院长、成都画院顾问、四川省政协常委等。

重庆市政协书画院专职副院长卢德龙表示：“冯老的书法师出吴门又取法汉魏碑刻，主要是从汉碑化出，并以其鲜明的个性寓于其中，行笔刚韧有劲，结体方言端庄，气韵朴茂古拙。可以说，冯老是我国当代阳刚大气这一路的代表性书家。”

冯建吴对山水画创作力主认真继承民族传统，面向社会生活和大自然，积极从艺术的角度反映现实，并在笔墨技法上努力探寻新的手段，以能生动鲜明地表现新的题材和新的意境，给人以新的美感享受。冯建吴的作品，上世纪六十年代以前基本上是纯传统，纯吴昌硕的一派作风。此后熔铸北朝书风和汉碑、汉简等为一体。创就了雄强、刚健、磅礴、朴茂、遒劲的艺术风格，其画从书出，亦具有深厚的传统功力和浓郁的个性色彩。

冯建吴极重对景写生，追求真实景物与笔墨形式语言的统一。在晚年，他还抱病登黄山、九华山、雁荡山，泛舟富春江、新安江，获稿逾千。所以他的山水既不贴于物象，又不离于物象，极重气局与骨力，几条遒劲的主线支撑大势，又多以居高俯视法取景，所画的高山白云、大江长河，气势逼人。